प्रोटीन आणविक भार कैलकुलेटर क्या है?
यह टूल किसी प्रोटीन के आणविक भार (MW) का तेज़, प्रारंभिक अनुमान सिर्फ़ उसकी लंबाई — यानी श्रृंखला में अमीनो एसिड अवशेषों की संख्या — के आधार पर देता है। चूँकि 20 सामान्य अमीनो एसिड का औसत अवशेष द्रव्यमान लगभग 110 डाल्टन (Da) होता है, इसलिए आप अवशेषों की संख्या को इस औसत से गुणा करके MW का अनुमान लगा सकते हैं। परिणाम डाल्टन और किलोडाल्टन (kDa) — दोनों में दिखाया जाता है।
इसका उपयोग कैसे करें
अपने प्रोटीन में अमीनो एसिड की संख्या (उसकी अनुक्रम लंबाई) दर्ज करें। मानक अनुमान के लिए औसत अवशेष द्रव्यमान को डिफ़ॉल्ट 110 Da पर ही रहने दें, या यदि आपको अपने प्रोटीन का कोई अधिक विशिष्ट औसत पता है तो उसे बदल दें। अनुमानित आणविक भार देखने के लिए कैलकुलेट पर क्लिक करें।
सूत्र की व्याख्या
गणना बस इतनी सी है — $$\text{MW} = N \times \bar{m}_{\text{residue}}$$ जहाँ \(N\) अवशेषों की संख्या है और \(\bar{m}\) औसत अवशेष द्रव्यमान है। व्यापक रूप से प्रयोग होने वाला सामान्य नियम है \(\bar{m} \approx 110\ \text{Da}\)। इसमें पहले से ही उस पानी के अणु का हिसाब शामिल है जो प्रत्येक पेप्टाइड बंध बनने के दौरान निकल जाता है, इसलिए आपको अलग से कुछ घटाने की ज़रूरत नहीं। डाल्टन मान को 1000 से भाग देने पर वह kDa में बदल जाता है, जो जैव रसायन में सबसे अधिक प्रयोग होने वाली इकाई है। $$\text{kDa} = \frac{\text{MW}_{\text{Da}}}{1000}$$
हल किया गया उदाहरण
मान लीजिए किसी प्रोटीन में 300 अमीनो एसिड हैं। औसत अवशेष द्रव्यमान 110 Da का उपयोग करते हुए: $$\text{MW} = 300 \times 110 = 33{,}000\ \text{Da}$$ यानी 33 kDa। यह इसे एक मध्यम आकार के गोलाकार प्रोटीन की सामान्य श्रेणी में रखता है।
अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न
110 Da का अनुमान कितना सटीक है? यह आमतौर पर वास्तविक द्रव्यमान के कुछ प्रतिशत के भीतर ही रहता है। एकदम सटीक मान के लिए अनुक्रम से वास्तविक अवशेष द्रव्यमानों का योग निकालें और उसमें एक पानी का अणु (~18 Da) जोड़ दें।
डाल्टन क्या है? डाल्टन (Da) एकीकृत परमाणु द्रव्यमान इकाई है, जो कार्बन-12 परमाणु के द्रव्यमान के 1/12 के बराबर होती है — मूलतः एक हाइड्रोजन परमाणु के द्रव्यमान जितनी।
किलोडाल्टन का उपयोग क्यों होता है? प्रोटीन बड़े होते हैं, इसलिए सुविधा के लिए उनका द्रव्यमान आमतौर पर kDa में बताया जाता है (1 kDa = 1000 Da), जैसे "एक 50 kDa प्रोटीन"।
