¿Qué es la calculadora de peso molecular de proteínas?
Esta herramienta ofrece una estimación rápida y aproximada del peso molecular (PM) de una proteína a partir únicamente de su longitud, es decir, del número de residuos de aminoácidos que forman la cadena. Como los 20 aminoácidos habituales tienen masas por residuo que promedian alrededor de 110 daltons (Da), puedes aproximar el PM multiplicando el número de residuos por esa masa media. El resultado se muestra tanto en daltons como en kilodaltons (kDa).
Cómo utilizarla
Introduce el número de aminoácidos de tu proteína (la longitud de su secuencia). Deja la masa media por residuo en su valor predeterminado de 110 Da para obtener una estimación estándar, o modifícalo si conoces un promedio más preciso para tu proteína. Pulsa calcular para ver el peso molecular estimado.
La fórmula, explicada
El cálculo es simplemente $$\text{PM} = N \times \bar{m}$$ donde \(N\) es el número de residuos y \(\bar{m}\) es la masa media por residuo. La regla práctica más utilizada es \(\bar{m} \approx 110\ \text{Da}\). Este valor ya tiene en cuenta la molécula de agua que se pierde al formarse cada enlace peptídico, por lo que no hace falta restar nada adicional. Al dividir el valor en daltons entre 1000 lo conviertes en kDa, la unidad que más se utiliza en bioquímica.
Ejemplo resuelto
Imagina una proteína con 300 aminoácidos. Usando la masa media por residuo de 110 Da: $$\text{PM} = 300 \times 110 = 33\,000\ \text{Da}$$ es decir, 33 kDa. Esto la sitúa dentro del rango típico de una proteína globular de tamaño medio.
Preguntas frecuentes
¿Qué precisión tiene la aproximación de 110 Da? Suele quedar dentro de un margen de pocos puntos porcentuales respecto a la masa real. Para obtener un valor exacto, suma las masas reales de los residuos a partir de la secuencia y añade una molécula de agua (~18 Da).
¿Qué es un dalton? Un dalton (Da) es la unidad de masa atómica unificada, equivalente a 1/12 de la masa de un átomo de carbono-12; en la práctica, la masa de un átomo de hidrógeno.
¿Por qué se usan los kilodaltons? Las proteínas son grandes, así que sus masas se expresan habitualmente en kDa (1 kDa = 1000 Da) por comodidad, por ejemplo «una proteína de 50 kDa».