Qué hace la calculadora de contenido GC
Esta herramienta calcula el contenido GC de cualquier secuencia de ADN, es decir, el porcentaje de bases que son guanina (G) o citosina (C). El contenido GC es una medida fundamental en biología molecular que se utiliza para comparar genomas, diseñar cebadores (primers) de PCR y predecir la temperatura de fusión y la estabilidad del ADN de doble cadena. Como los pares G–C están unidos por tres puentes de hidrógeno (frente a los dos de los pares A–T), las secuencias con más G y C suelen ser más estables térmicamente.
Cómo usarla
- Secuencia de ADN: pega o escribe tu secuencia usando las letras A, T, G y C.
- La entrada no distingue entre mayúsculas y minúsculas: «atgc» y «ATGC» dan el mismo resultado.
- Cualquier carácter que no sea A, T, G o C (espacios, números, N, saltos de línea) se elimina automáticamente antes del cálculo, y la calculadora te indica cuántos caracteres no válidos descartó.
Por ejemplo, al introducir ATGCATGCATGC obtienes el porcentaje al instante.
La fórmula
La calculadora cuenta las bases G y C de tu secuencia depurada y las divide entre el número total de bases válidas:
$$\text{GC\%} = \frac{N_G + N_C}{N_G + N_A + N_T + N_C} \times 100$$
También muestra el contenido AT complementario, aplicando la misma lógica con el recuento de A y T. Si no hay ninguna base válida, el resultado es simplemente 0.
Ejemplo resuelto
Tomemos la secuencia de ejemplo ATGCATGCATGC:
- Total de bases = 12
- Número de G = 3, número de C = 3, por lo que el recuento GC = 6
- Contenido GC = $$(6 \div 12) \times 100 = 50\,\%$$
- Recuento AT = 6, por lo que el contenido AT = 50 %
Una secuencia equilibrada como esta tiene el mismo contenido de GC y de AT.
Preguntas frecuentes
¿Por qué importa el contenido GC? Influye en la estabilidad del ADN y en su temperatura de fusión, ayuda a identificar regiones ricas en genes y resulta clave al diseñar cebadores para que se unan de forma fiable durante la PCR.
¿Qué ocurre con los caracteres no válidos? Letras como la N o la U, los huecos y los espacios se eliminan automáticamente. Solo se conservan y se cuentan las bases A, T, G y C, de modo que los espacios de una secuencia pegada no alteran tu resultado.
¿Acepta secuencias de ARN? La calculadora solo reconoce las bases del ADN (A, T, G, C). El uracilo (U) del ARN se filtraría, así que conviértelo en T antes de calcular para obtener una lectura precisa.
