Калькулятор GC-состава ДНК

Введите расчет

Последовательность ДНК: ATGCATGCATGC Enter a valid DNA sequence using only A, T, G, and C characters. The sequence is not case-sensitive.
Example: ATGCATGCATGC

Примечание: GC content is the percentage of nitrogenous bases in a DNA sequence that are either guanine (G) or cytosine (C).

Результатов

GC-состав

50%

Введённая последовательность ДНК	ATGCATGCATGC
Корректная последовательность ДНК	ATGCATGCATGC
Всего допустимых оснований	12
Число GC	6
Число AT	6
AT-состав	50%

■ GC-состав ■ AT-состав

Что считает калькулятор GC-состава

Этот инструмент рассчитывает GC-состав любой последовательности ДНК — то есть процент нуклеотидов, представленных гуанином (G) или цитозином (C). GC-состав — это базовый показатель молекулярной биологии, который используют для сравнения геномов, подбора праймеров для ПЦР и прогнозирования температуры плавления и стабильности двухцепочечной ДНК. Поскольку пары G–C связаны тремя водородными связями (против двух у пар A–T), участки с более высоким содержанием G и C, как правило, термически устойчивее.

GC-содержание подсчитывает основания гуанин (G) и цитозин (C) относительно всех четырёх оснований.

Как пользоваться

• Последовательность ДНК: вставьте или введите последовательность буквами A, T, G и C.
• Регистр не имеет значения — «atgc» и «ATGC» дадут одинаковый результат.
• Любые символы, кроме A, T, G и C (пробелы, цифры, N, переносы строк), автоматически удаляются перед расчётом, а калькулятор сообщает, сколько недопустимых символов было убрано.

Например, при вводе ATGCATGCATGC вы сразу получите процент.

Формула

Калькулятор подсчитывает количество оснований G и C в очищенной последовательности и делит его на общее число допустимых оснований:

$$\text{GC\%} = \frac{N_G + N_C}{N_G + N_A + N_T + N_C} \times 100$$

По той же логике, но уже для A и T, рассчитывается и комплементарный AT-состав. Если допустимых оснований нет, результат равен 0.

Реклама

GC% — это доля последовательности, состоящая из оснований G и C, выраженная в процентах.

Разбор примера

Возьмём последовательность ATGCATGCATGC:

• Всего оснований = 12
• Число G = 3, число C = 3, значит GC-счёт = 6
• GC-состав = $$(6 \div 12) \times 100 = \textbf{50\%}$$
• AT-счёт = 6, значит AT-состав = 50%

В такой сбалансированной последовательности GC- и AT-состав равны.

Часто задаваемые вопросы

Почему GC-состав важен? Он влияет на стабильность ДНК и температуру плавления, помогает выявлять богатые генами участки и учитывается при подборе праймеров, чтобы они надёжно связывались во время ПЦР.

Что происходит с недопустимыми символами? Буквы вроде N, U, пропуски и пробелы удаляются автоматически. Сохраняются и учитываются только A, T, G и C, поэтому пробелы во вставленной последовательности не исказят результат.

Подходит ли он для РНК? Калькулятор распознаёт только основания ДНК (A, T, G, C). Урацил (U) из РНК будет отфильтрован, поэтому для точного результата сначала замените U на T.