MCP๋กœ ์—ฐ๊ฒฐ โ†’

๊ณ„์‚ฐ ์ž…๋ ฅ

๊ณต์‹

๊ด‘๊ณ 

๊ฒฐ๊ณผ

A260/A280 ์ˆœ๋„ ๋น„์œจ
1.8
์•ฝ 1.8 = ์ˆœ์ˆ˜ DNA, ์•ฝ 2.0 = ์ˆœ์ˆ˜ RNA
A260 1.8
A280 1

A260/A280 ๋น„์œจ์ด๋ž€?

A260/A280 ๋น„์œจ์€ ๋ถ„๊ด‘๊ด‘๋„๊ณ„๋กœ ํ•ต์‚ฐ ์ˆœ๋„๋ฅผ ๋น ๋ฅด๊ฒŒ ๊ฐ€๋Š ํ•˜๋Š” ์ง€ํ‘œ์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ํ•ต์‚ฐ์€ 260 nm ํŒŒ์žฅ์˜ ์ž์™ธ์„ ์„ ๊ฐ•ํ•˜๊ฒŒ ํก์ˆ˜ํ•˜๋Š” ๋ฐ˜๋ฉด, ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์€ ํŠธ๋ฆฝํ† ํŒยทํ‹ฐ๋กœ์‹  ๊ฐ™์€ ๋ฐฉํ–ฅ์กฑ ์•„๋ฏธ๋…ธ์‚ฐ ๋•Œ๋ฌธ์— 280 nm์—์„œ ํก๊ด‘์„ ๋ณด์ž…๋‹ˆ๋‹ค. 260 nm ํก๊ด‘๋„๋ฅผ 280 nm ํก๊ด‘๋„๋กœ ๋‚˜๋ˆ„๋ฉด, DNA๋‚˜ RNA ์‹œ๋ฃŒ์— ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์ด๋‚˜ ๊ธฐํƒ€ ์˜ค์—ผ๋ฌผ์งˆ์ด ์–ผ๋งˆ๋‚˜ ์„ž์—ฌ ์žˆ๋Š”์ง€๋ฅผ ๋‚˜ํƒ€๋‚ด๋Š” ๋น„์œจ์„ ์–ป์„ ์ˆ˜ ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

260 nm์™€ 280 nm์—์„œ ์ •์ ์„ ์ด๋ฃจ๋Š” ํก๊ด‘๋„ ๊ณก์„ 
ํ•ต์‚ฐ์€ 260 nm ๋ถ€๊ทผ์—์„œ ๊ฐ€์žฅ ๊ฐ•ํ•˜๊ฒŒ ํก์ˆ˜ํ•˜๊ณ , ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์€ 280 nm ๋ถ€๊ทผ์—์„œ ์ •์ ์„ ๋ณด์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ ์‚ฌ์šฉ ๋ฐฉ๋ฒ•

NanoDrop ๊ฐ™์€ UV ๋ถ„๊ด‘๊ด‘๋„๊ณ„๋กœ ์‹œ๋ฃŒ๋ฅผ ์ธก์ •ํ•œ ๋’ค 260 nm์™€ 280 nm์—์„œ์˜ ํก๊ด‘๋„ ๊ฐ’์„ ํ™•์ธํ•˜์„ธ์š”. ๋‘ ๊ฐ’์„ ์œ„ ์ž…๋ ฅ๋ž€์— ๋„ฃ์œผ๋ฉด ๋น„์œจ์ด ์ฆ‰์‹œ ๊ณ„์‚ฐ๋ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ์ •ํ™•ํ•œ ์ธก์ •์„ ์œ„ํ•ด ๋ธ”๋žญํฌ ๋ณด์ •์„ ๊ฑฐ์น˜๊ณ  ์ ์ ˆํžˆ ํฌ์„ํ•œ ์‹œ๋ฃŒ๋ฅผ ์‚ฌ์šฉํ•˜๋Š” ๊ฒƒ์ด ์ข‹์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

๊ณ„์‚ฐ ๊ณต์‹

๊ณ„์‚ฐ์€ ์•„์ฃผ ๊ฐ„๋‹จํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

$$\text{Ratio} = \dfrac{A_{260}}{A_{280}}$$

๊ฐ™์€ ์‹œ๋ฃŒ์—์„œ ์ธก์ •ํ•œ ๋‘ ํก๊ด‘๋„์˜ ๋น„์œจ์ด๊ธฐ ๋•Œ๋ฌธ์— ๊ด‘๊ฒฝ๋กœ ๊ธธ์ด์™€ ๋†๋„๊ฐ€ ๋Œ€๋ถ€๋ถ„ ์ƒ์‡„๋˜๋ฉฐ, ์‹œ๋ฃŒ ๋†๋„์™€ ๋ฌด๊ด€ํ•˜๊ฒŒ ์•ˆ์ •์ ์ธ ํ’ˆ์งˆ ์ง€ํ‘œ๋กœ ํ™œ์šฉํ•  ์ˆ˜ ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

๊ฒฐ๊ณผ ํ•ด์„ํ•˜๊ธฐ

์ผ๋ฐ˜์ ์œผ๋กœ DNA๋Š” ์•ฝ 1.8, RNA๋Š” ์•ฝ 2.0์ผ ๋•Œ "์ˆœ์ˆ˜"ํ•œ ๊ฒƒ์œผ๋กœ ๋ด…๋‹ˆ๋‹ค. ๋น„์œจ์ด ๋ˆˆ์— ๋„๊ฒŒ ๋‚ฎ์œผ๋ฉด(์˜ˆ: 1.7 ๋ฏธ๋งŒ) 280 nm ๋ถ€๊ทผ์—์„œ ํก๊ด‘ํ•˜๋Š” ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ, ํŽ˜๋†€, ๊ธฐํƒ€ ์˜ค์—ผ๋ฌผ์งˆ์ด ์กด์žฌํ•  ๊ฐ€๋Šฅ์„ฑ์ด ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค. ๋ฐ˜๋Œ€๋กœ ์˜ˆ์ƒ๋ณด๋‹ค ๋†’์€ ๋น„์œจ์€ DNA ์‹œ๋ฃŒ์— RNA๊ฐ€ ํ˜ผ์ž…๋˜์—ˆ์„ ๋•Œ ๋‚˜ํƒ€๋‚  ์ˆ˜ ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

DNA์™€ RNA์˜ ์ˆœ๋„ ๋น„์œจ ๋ฒ”์œ„๋ฅผ ๋ณด์—ฌ์ฃผ๋Š” ์ˆ˜์ง์„ 
์ผ๋ฐ˜์ ์ธ ์ˆœ๋„ ๊ธฐ์ค€: ์ˆœ์ˆ˜ DNA๋Š” ์•ฝ 1.8, ์ˆœ์ˆ˜ RNA๋Š” ์•ฝ 2.0.

๊ณ„์‚ฐ ์˜ˆ์‹œ

์˜ˆ๋ฅผ ๋“ค์–ด NanoDrop์—์„œ \(A_{260} = 1.8\), \(A_{280} = 1.0\)์œผ๋กœ ์ธก์ •๋˜์—ˆ๋‹ค๊ณ  ํ•ฉ์‹œ๋‹ค. ๋น„์œจ์€

$$\text{Ratio} = \dfrac{1.8}{1.0} = 1.8$$

์ด๋ฉฐ, ์ด๋Š” ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ ์˜ค์—ผ์ด ๊ฑฐ์˜ ์—†๋Š” ๊นจ๋—ํ•œ ๊ฒŒ๋†ˆ DNA์ž„์„ ์˜๋ฏธํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

A260/A280 ์ˆœ๋„ ์ฐธ๊ณ ๊ฐ’

A260/A280 ๋น„์œจ์€ 260 nm์—์„œ์˜ ํก๊ด‘๋„(ํ•ต์‚ฐ์˜ ํก์ˆ˜ ์ตœ๋Œ€๊ฐ’)์™€ 280 nm์—์„œ์˜ ํก๊ด‘๋„(๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์˜ ๋ฐฉํ–ฅ์กฑ ์•„๋ฏธ๋…ธ์‚ฐ์˜ ํก์ˆ˜ ์ตœ๋Œ€๊ฐ’)๋ฅผ ๋น„๊ตํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ์ •์ œ๋œ DNA์™€ RNA๋Š” ํŠน์„ฑ์ ์ธ ๋น„์œจ์„ ๊ฐ€์ง€๋ฏ€๋กœ, ์ด ๊ฐ’์€ ์ƒ˜ํ”Œ์ด ์–ผ๋งˆ๋‚˜ ๊นจ๋—ํ•œ์ง€ ๋น ๋ฅด๊ฒŒ ๋ถ„๊ด‘๊ด‘๋„๊ณ„๋กœ ํ™•์ธํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ๋ฐฉ๋ฒ•์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ์ƒ๋ณด์ ์ธ A260/A230 ๋น„์œจ์€ ๋‹ค๋ฅธ ์ข…๋ฅ˜์˜ ์˜ค์—ผ๋ฌผ์งˆ(์œ ๊ธฐ ํ™”ํ•ฉ๋ฌผ๊ณผ ์นด์˜คํŠธ๋กœํ”ฝ ์—ผ)์„ ๊ฒ€์ถœํ•˜๋ฏ€๋กœ, ๋‘ ๊ฐœ๋Š” ๋ณดํ†ต ํ•จ๊ป˜ ๋ณด๊ณ ๋ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

์ƒ˜ํ”Œ / ์กฐ๊ฑด ์˜ˆ์ƒ A260/A280 ์˜ˆ์ƒ A260/A230 ํ•ด์„
์ˆœ์ˆ˜ ์ด์ค‘ ๋‚˜์„  DNA (dsDNA) ~1.8 ~2.0โ€“2.2 ๊นจ๋—ํ•œ ๊ฒŒ๋†ˆ/ํ”Œ๋ผ์Šค๋ฏธ๋“œ DNA์˜ ํ—ˆ์šฉ ๋ชฉํ‘œ๊ฐ’
์ˆœ์ˆ˜ RNA ~2.0 ~2.0โ€“2.2 ๊นจ๋—ํ•œ ์ „์ฒด/๋ฉ”์‹ ์ € RNA์˜ ํ—ˆ์šฉ ๋ชฉํ‘œ๊ฐ’
์ˆœ์ˆ˜ ๋‹จ์ผ ๋‚˜์„  DNA (ssDNA) / ์˜ฌ๋ฆฌ๊ณ ๋‰ดํด๋ ˆ์˜คํ‹ฐ๋“œ ~1.9 ~2.0โ€“2.2 ์—ผ๊ธฐ ์กฐ์„ฑ์— ๋”ฐ๋ผ dsDNA์™€ RNA ์‚ฌ์ด์—์„œ ๋ณ€ํ•จ
A260/A280์ด ~1.7 ๋ฏธ๋งŒ < 1.7 โ€” ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ, ํŽ˜๋†€ ๋˜๋Š” ๊ธฐํƒ€ 280 nm ํก์ˆ˜๋ฌผ์งˆ์ด ์กด์žฌํ•  ๊ฐ€๋Šฅ์„ฑ
A260/A280์ด ~2.0 ์ดˆ๊ณผ (DNA์˜ ๊ฒฝ์šฐ) > 2.0 โ€” RNA ํ˜ผ์ž…, ๋ถ„ํ•ด๋œ ๋‰ดํด๋ ˆ์˜คํ‹ฐ๋“œ ๋˜๋Š” ์•Œ์นผ๋ฆฌ์„ฑ pH ๊ฐ€๋Šฅ์„ฑ
๋‚ฎ์€ A260/A230 (์˜ˆ: < 1.8) โ€” < 1.8 ๊ตฌ์•„๋‹ˆ๋”˜ ์—ผ, ํŽ˜๋†€, EDTA ๋˜๋Š” ํƒ„์ˆ˜ํ™”๋ฌผ ์˜ค์—ผ

์ผ๋ฐ˜์ ์ธ ์˜ค์—ผ๋ฌผ์งˆ๊ณผ ๊ทธ ์˜ํ–ฅ

  • ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ โ€” 280 nm์—์„œ ๊ฐ•ํ•˜๊ฒŒ ํก์ˆ˜(ํŠธ๋ฆฝํ† ํŒ, ํ‹ฐ๋กœ์‹ , ํŽ˜๋‹์•Œ๋ผ๋‹Œ)ํ•˜์—ฌ A260/A280 ๋น„์œจ์„ 1.8 ๋ฏธ๋งŒ์œผ๋กœ ๋‚ฎ์ถฅ๋‹ˆ๋‹ค.
  • ํŽ˜๋†€ โ€” ํŽ˜๋†€-ํด๋กœ๋กœํฌ๋ฆ„ ์ถ”์ถœ์˜ ์ž”๋ฅ˜๋ฌผ; 270โ€“280 nm ๊ทผ์ฒ˜์™€ 230 nm์—์„œ๋„ ํก์ˆ˜ํ•˜์—ฌ ๋‘ ๋น„์œจ ๋ชจ๋‘๋ฅผ ๋‚ฎ์ถ”๊ณ  ๊ฒ‰๋ณด๊ธฐ ์ˆ˜์œจ์„ ๋†’์ž…๋‹ˆ๋‹ค.
  • ๊ตฌ์•„๋‹ˆ๋”˜ / ์นด์˜คํŠธ๋กœํ”ฝ ์—ผ ๋ฐ EDTA โ€” ์•ฝ 230 nm ์ฃผ๋ณ€์—์„œ ํก์ˆ˜ํ•˜์—ฌ ์ฃผ๋กœ A260/A230 ๋น„์œจ์„ ๋‚ฎ์ถ”๋ฉด์„œ A260/A280๋Š” ์ •์ƒ์— ๊ฐ€๊น๊ฒŒ ์œ ์ง€๋ฉ๋‹ˆ๋‹ค.
  • DNA ์ค€๋น„์—์„œ RNA โ€” ์ด ๋น„์œจ์—์„œ RNA๊ฐ€ DNA๋ณด๋‹ค ๋†’๊ฒŒ ๋‚˜ํƒ€๋‚˜๋ฏ€๋กœ A260/A280 ๋น„์œจ์„ ์ƒํ–ฅ(2.0 ๋ฐฉํ–ฅ)์œผ๋กœ ์˜ฌ๋ฆฝ๋‹ˆ๋‹ค.

์ž‘์—… ์˜ˆ์‹œ: ๋ถ„๊ด‘๊ด‘๋„๊ณ„๊ฐ€ A260 = 0.452, A280 = 0.251์„ ๋‚˜ํƒ€๋ƒ…๋‹ˆ๋‹ค. ์ˆœ๋„ ๋น„์œจ์€ 1.80์œผ๋กœ, ๊นจ๋—ํ•œ ์ด์ค‘ ๋‚˜์„  DNA๋ฅผ ๋‚˜ํƒ€๋ƒ…๋‹ˆ๋‹ค. ๋น„์œจ์€ pH ~7.5โ€“8.5์—์„œ ์ ์ ˆํ•œ ๋ฒ„ํผ ๊ณต๋ฐฑ์œผ๋กœ ์ธก์ •ํ•  ๋•Œ๋งŒ ์˜๋ฏธ๊ฐ€ ์žˆ์œผ๋ฉฐ, ์‚ฐ์„ฑ ์กฐ๊ฑด์—์„œ๋Š” ๊ฐ’์„ ์ตœ๋Œ€ ~0.2โ€“0.3๊นŒ์ง€ ์ธ์œ„์ ์œผ๋กœ ๋‚ฎ์ถœ ์ˆ˜ ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

์ž์ฃผ ๋ฌป๋Š” ์งˆ๋ฌธ

์–ด๋–ค ๊ฐ’์ด ์ˆœ์ˆ˜ํ•œ DNA๋ฅผ ์˜๋ฏธํ•˜๋‚˜์š”? ์•ฝ 1.8 ์ •๋„๋ฉด ์ˆœ์ˆ˜ํ•œ ์ด์ค‘๊ฐ€๋‹ฅ DNA๋กœ ๋ด…๋‹ˆ๋‹ค.

RNA๋Š” ์–ด๋–ค๊ฐ€์š”? ์ˆœ์ˆ˜ํ•œ RNA๋Š” ๋ณดํ†ต ์•ฝ 2.0์˜ ๋น„์œจ์„ ๋ณด์ž…๋‹ˆ๋‹ค.

A260/A230๋„ ํ™•์ธํ•ด์•ผ ํ•˜๋‚˜์š”? ๋„ค, ๊ถŒ์žฅํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. A260/A230 ๋น„์œจ(์ด์ƒ์ ์œผ๋กœ 2.0~2.2)์€ A260/A280๋งŒ์œผ๋กœ๋Š” ๋†“์น  ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ๊ตฌ์•„๋‹ˆ๋”˜์ด๋‚˜ ํŽ˜๋†€ ๊ฐ™์€ ์œ ๊ธฐ ์˜ค์—ผ๋ฌผ์งˆ์„ ์žก์•„๋‚ด๋Š” ๋ฐ ๋„์›€์ด ๋ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

์ตœ์ข… ์—…๋ฐ์ดํŠธ: