Что такое калькулятор концентрации ДНК?
Этот калькулятор оценивает концентрацию двухцепочечной ДНК (дцДНК) в образце по значению оптической плотности при длине волны 260 нм (A260), измеренному на спектрофотометре — например, на NanoDrop или классическом УФ-приборе с кюветой. Нуклеиновые кислоты сильно поглощают ультрафиолет на 260 нм, и эта величина поглощения прямо пропорциональна концентрации. Именно поэтому такой способ стал стандартным быстрым методом количественной оценки ДНК в лабораториях молекулярной биологии.
Как пользоваться
Введите значение оптической плотности A260, которое показывает ваш спектрофотометр. Укажите фактор разведения: если перед измерением вы разбавили образец 1:10, фактор равен 10; если измеряли неразбавленный образец, ставьте 1. По желанию можно ввести общий объём образца в микролитрах — тогда калькулятор дополнительно оценит суммарный выход ДНК. В результате вы получите концентрацию в нг/мкл (численно равную мкг/мл) и общую массу ДНК.
Разбор формулы
Расчёт выполняется по формуле $$\text{Концентрация (нг/мкл)} = A_{260} \times 50 \times \text{фактор разведения}$$. Множитель 50 — это константа пересчёта для дцДНК: образец с длиной оптического пути 1 см и \(A_{260}\), равным ровно 1,0, содержит примерно 50 нг/мкл двухцепочечной ДНК. Для одноцепочечной ДНК используют коэффициент 33, для РНК — 40, но этот калькулятор рассчитан именно на дцДНК. Суммарный выход в микрограммах $$\text{выход} = \frac{\text{концентрация} \times \text{объём}}{1000}$$
Пример расчёта
Допустим, ваш NanoDrop показал \(A_{260} = 0{,}5\) для образца, разбавленного 1:10, при итоговом объёме 50 мкл. Концентрация $$0{,}5 \times 50 \times 10 = 250 \text{ нг/мкл}$$ Суммарный выход $$\frac{250 \times 50}{1000} = 12{,}5 \text{ мкг}$$
Частые вопросы
Почему именно 50? Это эмпирически установленный коэффициент экстинкции для дцДНК при 260 нм и длине оптического пути 1 см.
Какой фактор разведения, если я не разбавлял образец? Используйте значение 1.
нг/мкл — это то же самое, что мкг/мл? Да, эти единицы численно совпадают, поэтому 250 нг/мкл равны 250 мкг/мл.