DNA рд╕рд╛рдВрджреНрд░рддрд╛ рдХреИрд▓рдХреБрд▓реЗрдЯрд░ рдХреНрдпрд╛ рд╣реИ?
рдпрд╣ рдХреИрд▓рдХреБрд▓реЗрдЯрд░ рдЖрдкрдХреЗ рдирдореВрдиреЗ рдореЗрдВ рдбрдмрд▓-рд╕реНрдЯреНрд░реИрдВрдбреЗрдб DNA (dsDNA) рдХреА рд╕рд╛рдВрджреНрд░рддрд╛ рдХрд╛ рдЕрдиреБрдорд╛рди 260 nm рдкрд░ рдорд╛рдкреЗ рдЧрдП рдЕрд╡рд╢реЛрд╖рдг (A260) рд╕реЗ рд▓рдЧрд╛рддрд╛ рд╣реИред рдпрд╣ рдорд╛рдк рдХрд┐рд╕реА рд╕реНрдкреЗрдХреНрдЯреНрд░реЛрдлреЛрдЯреЛрдореАрдЯрд░ тАФ рдЬреИрд╕реЗ NanoDrop рдпрд╛ рдХреНрдпреВрд╡реЗрдЯ-рдЖрдзрд╛рд░рд┐рдд UV рдЙрдкрдХрд░рдг тАФ рдкрд░ рд▓рд┐рдпрд╛ рдЬрд╛рддрд╛ рд╣реИред рдиреНрдпреВрдХреНрд▓рд┐рдХ рдЕрдореНрд▓ 260 nm рдкрд░ UV рдкреНрд░рдХрд╛рд╢ рдХреЛ рдмрд╣реБрдд рдкреНрд░рдмрд▓рддрд╛ рд╕реЗ рд╕реЛрдЦрддреЗ рд╣реИрдВ, рдФрд░ рдпрд╣ рдЕрд╡рд╢реЛрд╖рдг рд╕реАрдзреЗ рд╕рд╛рдВрджреНрд░рддрд╛ рдХреЗ рд╕рдорд╛рдиреБрдкрд╛рддреА рд╣реЛрддрд╛ рд╣реИред рдЗрд╕реА рд╡рдЬрд╣ рд╕реЗ рдпрд╣ рдЖрдгрд╡рд┐рдХ рдЬреАрд╡рд╡рд┐рдЬреНрдЮрд╛рди (molecular biology) рдХреА рдкреНрд░рдпреЛрдЧрд╢рд╛рд▓рд╛рдУрдВ рдореЗрдВ DNA рдХреА рдорд╛рддреНрд░рд╛ рдЬрд▓реНрджреА рдЖрдБрдХрдиреЗ рдХреА рдорд╛рдирдХ рд╡рд┐рдзрд┐ рд╣реИред
рдЗрд╕рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХреИрд╕реЗ рдХрд░реЗрдВ
рдЕрдкрдиреЗ рд╕реНрдкреЗрдХреНрдЯреНрд░реЛрдлреЛрдЯреЛрдореАрдЯрд░ рдкрд░ рджрд┐рдЦрдиреЗ рд╡рд╛рд▓рд╛ A260 рдЕрд╡рд╢реЛрд╖рдг рдорд╛рди рджрд░реНрдЬ рдХрд░реЗрдВред рдлрд┐рд░ рддрдиреБрдХрд░рдг рдХрд╛рд░рдХ (dilution factor) рднрд░реЗрдВ тАФ рдЕрдЧрд░ рдЖрдкрдиреЗ рд░реАрдбрд┐рдВрдЧ рд▓реЗрдиреЗ рд╕реЗ рдкрд╣рд▓реЗ рдирдореВрдиреЗ рдХреЛ 1:10 рддрдиреБ рдХрд┐рдпрд╛ рдерд╛, рддреЛ рдХрд╛рд░рдХ 10 рд╣реЛрдЧрд╛; рдФрд░ рдЕрдЧрд░ рдЖрдкрдиреЗ рдмрд┐рдирд╛ рддрдиреБ рдХрд┐рдП рд╕реАрдзреЗ рдкрдврд╝рд╛ рд╣реИ, рддреЛ 1 рд▓рд┐рдЦреЗрдВред рдЪрд╛рд╣реЗрдВ рддреЛ рдорд╛рдЗрдХреНрд░реЛрд▓реАрдЯрд░ рдореЗрдВ рдХреБрд▓ рдирдореВрдирд╛ рдЖрдпрддрди рднреА рджрд░реНрдЬ рдХрд░реЗрдВ, рддрд╛рдХрд┐ рдХреБрд▓ DNA рдЙрдкрдЬ (yield) рдХрд╛ рдЕрдиреБрдорд╛рди рднреА рдорд┐рд▓ рд╕рдХреЗред рдпрд╣ рдЙрдкрдХрд░рдг рдЖрдкрдХреЛ рд╕рд╛рдВрджреНрд░рддрд╛ ng/┬╡L рдореЗрдВ (рдФрд░ рд╕рдВрдЦреНрдпрд╛рддреНрдордХ рд░реВрдк рд╕реЗ рд╕рдорд╛рди ┬╡g/mL рдореЗрдВ) рддрдерд╛ рдХреБрд▓ рджреНрд░рд╡реНрдпрдорд╛рди рдмрддрд╛рддрд╛ рд╣реИред
рд╕реВрддреНрд░ рдХреА рд╡реНрдпрд╛рдЦреНрдпрд╛
рдЧрдгрдирд╛ рдЗрд╕ рдкреНрд░рдХрд╛рд░ рд╣реЛрддреА рд╣реИ: $$\text{рд╕рд╛рдВрджреНрд░рддрд╛ (ng/┬╡L)} = A_{260} \times 50 \times \text{рддрдиреБрдХрд░рдг рдХрд╛рд░рдХ}$$ред рдпрд╣рд╛рдБ 50 dsDNA рдХреЗ рд▓рд┐рдП рд░реВрдкрд╛рдВрддрд░рдг рд╕реНрдерд┐рд░рд╛рдВрдХ рд╣реИ: 1 cm рдкрд╛рде-рд▓реЗрдВрде рд╡рд╛рд▓реЗ рдирдореВрдиреЗ рдХрд╛ A260 рдареАрдХ 1.0 рд╣реЛрдиреЗ рдкрд░ рдЙрд╕рдореЗрдВ рд▓рдЧрднрдЧ 50 ng/┬╡L рдбрдмрд▓-рд╕реНрдЯреНрд░реИрдВрдбреЗрдб DNA рдореМрдЬреВрдж рд╣реЛрддрд╛ рд╣реИред рд╕рд┐рдВрдЧрд▓-рд╕реНрдЯреНрд░реИрдВрдбреЗрдб DNA рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдпрд╣ рдорд╛рди 33 рдФрд░ RNA рдХреЗ рд▓рд┐рдП 40 рд╣реЛрддрд╛ рд╣реИ, рдкрд░рдВрддреБ рдпрд╣ рдЙрдкрдХрд░рдг dsDNA рдорд╛рдирдХрд░ рдЪрд▓рддрд╛ рд╣реИред рдорд╛рдЗрдХреНрд░реЛрдЧреНрд░рд╛рдо рдореЗрдВ рдХреБрд▓ рдЙрдкрдЬ $$\text{рдЙрдкрдЬ}_{\mu g} = \frac{C \times V}{1000}$$
рд╣рд▓ рдХрд┐рдпрд╛ рд╣реБрдЖ рдЙрджрд╛рд╣рд░рдг
рдорд╛рди рд▓реАрдЬрд┐рдП рдЖрдкрдХрд╛ NanoDrop рдХрд┐рд╕реА 1:10 рддрдиреБ рдХрд┐рдП рдЧрдП рдирдореВрдиреЗ рдкрд░ \(A_{260} = 0.5\) рджрд┐рдЦрд╛рддрд╛ рд╣реИ, рдФрд░ рдЕрдВрддрд┐рдо рдЖрдпрддрди 50 ┬╡L рд╣реИред рддрдм рд╕рд╛рдВрджреНрд░рддрд╛ $$= 0.5 \times 50 \times 10 = 250 \text{ ng/┬╡L}$$ рдХреБрд▓ рдЙрдкрдЬ $$= \frac{250 \times 50}{1000} = 12.5 \text{ ┬╡g}$$
рдЕрдХреНрд╕рд░ рдкреВрдЫреЗ рдЬрд╛рдиреЗ рд╡рд╛рд▓реЗ рдкреНрд░рд╢реНрди
50 рд╣реА рдХреНрдпреЛрдВ? рдпрд╣ 260 nm рдФрд░ 1 cm рдкрд╛рде-рд▓реЗрдВрде рдкрд░ dsDNA рдХреЗ рд▓рд┐рдП рдкреНрд░рдпреЛрдЧреЛрдВ рд╕реЗ рд╕реНрдерд╛рдкрд┐рдд рд╡рд┐рд▓реЛрдкрди рдХрд╛рд░рдХ (extinction factor) рд╣реИред
рдЕрдЧрд░ рдореИрдВрдиреЗ рдирдореВрдиреЗ рдХреЛ рддрдиреБ рд╣реА рдирд╣реАрдВ рдХрд┐рдпрд╛ рддреЛ рддрдиреБрдХрд░рдг рдХрд╛рд░рдХ рдХреНрдпрд╛ рд╣реЛрдЧрд╛? 1 рдХрд╛ рдЙрдкрдпреЛрдЧ рдХрд░реЗрдВред
рдХреНрдпрд╛ ng/┬╡L рдФрд░ ┬╡g/mL рдПрдХ рд╣реА рд╣реИрдВ? рд╣рд╛рдБ тАФ рджреЛрдиреЛрдВ рд╕рдВрдЦреНрдпрд╛рддреНрдордХ рд░реВрдк рд╕реЗ рдмрд░рд╛рдмрд░ рд╣реИрдВ, рдпрд╛рдиреА 250 ng/┬╡L рдХрд╛ рдЕрд░реНрде 250 ┬╡g/mL рд╣реА рд╣реИред