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公式

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  1. Total RNA Yield

    Total RNA Yield: RNA濃度計算ツール

    Yield in micrograms = concentration (ng/uL) x sample volume (uL) / 1000.

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結果

RNA濃度
10
ng/µL
濃度(µg/mL) 10 µg/mL
総RNA収量 1 µg

RNA濃度計算ツールとは?

このツールは、NanoDropなどの紫外可視分光光度計で測定した260 nmの吸光度(A260)から、RNAサンプルの濃度を推定します。一本鎖RNAの標準的なモル吸光係数に基づく換算を採用しており、A260が1.0のときRNA濃度はおよそ40 ng/µLに相当します。世界中のどの研究室でも共通して使える、汎用的な計算ツールです。

使い方

測定したA260値と、測定前の希釈倍率(希釈せずそのまま測定した場合は1)を入力します。さらに、総RNA収量を求めたい場合は、サンプル量(µL)も入力してください。計算結果として、ng/µL単位の濃度(µg/mLと同値)と、回収されたRNAの総量が表示されます。

計算式の解説

RNA濃度(ng/µL)=

$$\text{RNA濃度} = \text{A260} \times 40 \times \text{希釈倍率} \;\;\text{(ng/}\mu\text{L)}$$

この係数40は、光路長1 cmのセルで測定した一本鎖RNAの260 nmにおける吸光特性から経験的に導かれた値です。総収量(µg)=

$$\text{総収量 (}\mu\text{g)} = \frac{\text{濃度 (ng/}\mu\text{L)} \times \text{量 (}\mu\text{L)}}{1000}$$

で求められます。

Diagram showing UV light passing through an RNA sample cuvette to a detector, with A260 absorbance multiplied by 40 and dilution factor
RNA concentration is derived from A260 absorbance using the 40 ng/µL factor and the dilution factor.

計算例

A260 = 0.25、希釈倍率 = 50、サンプル量 = 100 µLの場合を考えてみましょう。濃度 =

$$0.25 \times 40 \times 50 = 500 \;\text{ng/}\mu\text{L}$$

となります。総収量 =

$$\frac{500 \times 100}{1000} = 50 \;\mu\text{g}$$

のRNAが得られた計算です。

Bar comparison of pure RNA at A260/A280 ratio 2.0 versus contaminated sample with lower ratio
An A260/A280 ratio near 2.0 indicates pure RNA, helping validate the calculated concentration.

よくある質問(FAQ)

なぜ50ではなく40なの? 係数50は二本鎖DNAに使われる値です。一本鎖RNAは吸光特性がわずかに異なるため、A260が1単位あたり40 ng/µLという定数が標準的に用いられます。

純度はどう確認する? A260だけでは濃度しか分かりません。純度を評価するには、A260/A280比(純粋なRNAでおよそ2.0)と、夾雑物の有無を示すA260/A230比を確認しましょう。

光路長は関係ある? この係数は標準的な光路長1 cmを前提としています。最新のマイクロボリューム測定機器は、測定値を自動的に1 cm換算に補正します。

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