MCP๋กœ ์—ฐ๊ฒฐ โ†’

๊ณ„์‚ฐ ์ž…๋ ฅ


์ค‘ํ•ฉํšจ์†Œ ๋ฒ„ํผ

dNTP

์ •๋ฐฉํ–ฅ ํ”„๋ผ์ด๋จธ

์—ญ๋ฐฉํ–ฅ ํ”„๋ผ์ด๋จธ

DNA ์ค‘ํ•ฉํšจ์†Œ

๊ณต์‹

Show calculation steps (1)
  1. Nuclease-Free Water Volume

    Nuclease-Free Water Volume: PCR ๋งˆ์Šคํ„ฐ ๋ฏน์Šค ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ

    Water fills the remaining volume after all components and template. N = Reactions x (1 + Excess/100); template scaled by N.

๊ด‘๊ณ 

๊ฒฐ๊ณผ

์ „์ฒด ๋งˆ์Šคํ„ฐ ๋ฏน์Šค ์šฉ๋Ÿ‰
275
ยตL (for 11 effective reactions)
์„ฑ๋ถ„ ์šฉ๋Ÿ‰ (ยตL)
๋ฒ„ํผ 27.5
dNTP 5.5
์ •๋ฐฉํ–ฅ ํ”„๋ผ์ด๋จธ 13.75
์—ญ๋ฐฉํ–ฅ ํ”„๋ผ์ด๋จธ 13.75
DNA ์ค‘ํ•ฉํšจ์†Œ 1.38
์ฃผํ˜• DNA 11
๋‰ดํด๋ ˆ์•„์ œ ๋ฌด์ฒจ๊ฐ€ ์ •์ œ์ˆ˜ 202.12

PCR ๋งˆ์Šคํ„ฐ ๋ฏน์Šค ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ๋ž€?

PCR ๋งˆ์Šคํ„ฐ ๋ฏน์Šค ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ๋Š” ์—ฌ๋Ÿฌ ๊ฐœ์˜ ์ค‘ํ•ฉํšจ์†Œ ์—ฐ์‡„๋ฐ˜์‘(PCR) ํŠœ๋ธŒ๋ฅผ ํ•œ ๋ฒˆ์— ์ค€๋น„ํ•  ๋•Œ ๊ฐ ์‹œ์•ฝ์„ ์–ผ๋งˆ๋‚˜ ๋„ฃ์–ด์•ผ ํ•˜๋Š”์ง€ ๊ณ„์‚ฐํ•ด ์ฃผ๋Š” ๋„๊ตฌ์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ํŠœ๋ธŒ๋งˆ๋‹ค ์‹œ์•ฝ์„ ํ•˜๋‚˜ํ•˜๋‚˜ ๋ถ„์ฃผํ•˜๋Š” ๋Œ€์‹ , ๊ณตํ†ต์œผ๋กœ ์“ธ ๋งˆ์Šคํ„ฐ ๋ฏน์Šค๋ฅผ ํ•œ๊บผ๋ฒˆ์— ๋งŒ๋“ค์–ด ๋‚˜๋ˆ  ๋‹ด๋Š” ๋ฐฉ์‹์ด์ฃ . ์ด ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ๋Š” ๋ฐ˜์‘ ์ˆ˜์— ํ”ผํŽซํŒ… ์—ฌ์œ ๋ถ„์„ ๋”ํ•ด ๋ชจ๋“  ์‹œ์•ฝ์„ ์ž๋™์œผ๋กœ ์Šค์ผ€์ผ๋งํ•˜๋ฏ€๋กœ ๋ง‰ํŒ์— ์‹œ์•ฝ์ด ๋ชจ์ž๋ž„ ์ผ์ด ์—†์Šต๋‹ˆ๋‹ค.

ํ•˜๋‚˜์˜ ๊ณต์šฉ ๋งˆ์Šคํ„ฐ ๋ฏน์Šค ํŠœ๋ธŒ๊ฐ€ ์—ฌ๋Ÿฌ ๋ฐ˜์‘ ํŠœ๋ธŒ๋กœ ๋‚˜๋‰˜๋Š” ๊ณผ์ •์„ ๋ณด์—ฌ์ฃผ๋Š” ๋‹ค์ด์–ด๊ทธ๋žจ
๋งˆ์Šคํ„ฐ ๋ฏน์Šค๋ฅผ ํ•œ ๋ฒˆ ๋งŒ๋“  ๋’ค ๋ชจ๋“  ๋ฐ˜์‘ ํŠœ๋ธŒ์— ๊ท ๋“ฑํ•˜๊ฒŒ ๋ถ„์ฃผํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค.

์‚ฌ์šฉ ๋ฐฉ๋ฒ•

1ํšŒ ๋ฐ˜์‘ ์šฉ๋Ÿ‰, ๋ฐ˜์‘ ์ˆ˜, ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ  ํ”ผํŽซํŒ… ์—ฌ์œ ๋ถ„(๋ณดํ†ต 5~10%)์„ ์ž…๋ ฅํ•˜์„ธ์š”. ์‹œ์•ฝ๋ณ„๋กœ๋Š” ์Šคํ†ก ๋†๋„์™€ ๋ฐ˜์‘ ๋‚ด ๋ชฉํ‘œ ์ตœ์ข… ๋†๋„๋ฅผ ์ž…๋ ฅํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ๊ทธ๋Ÿฌ๋ฉด ๊ณ„์‚ฐ๊ธฐ๊ฐ€ ๊ฐ ์‹œ์•ฝ์˜ ์šฉ๋Ÿ‰, ์ฃผํ˜•(template) ์šฉ๋Ÿ‰, ๊ทธ๋ฆฌ๊ณ  ๋ถ€ํ”ผ๋ฅผ ๋งž์ถ”๋Š” nuclease-free water(๋‰ดํด๋ ˆ์•„์ œ ๋ฌด์ฒจ๊ฐ€ ์ •์ œ์ˆ˜) ์–‘๊นŒ์ง€ ํ•œ ๋ฒˆ์— ์•Œ๋ ค์ค๋‹ˆ๋‹ค.

๊ณต์‹ ํ’€์ด

๊ฐ ์‹œ์•ฝ ์šฉ๋Ÿ‰์€ ํฌ์„ ๊ด€๊ณ„์‹ \(C_1 V_1 = C_2 V_2\)์—์„œ ๋‚˜์˜ต๋‹ˆ๋‹ค. ๋งˆ์Šคํ„ฐ ๋ฏน์Šค์˜ ๊ฒฝ์šฐ ์œ ํšจ ๋ฐ˜์‘ ์ˆ˜ \(n = \text{๋ฐ˜์‘ ์ˆ˜} \times \left(1 + \frac{\text{์—ฌ์œ ๋ถ„}}{100}\right)\)์„ ๊ณฑํ•ด ์ค๋‹ˆ๋‹ค:

$$V = \frac{C_{\text{์ตœ์ข…}} \times V_{\text{๋ฐ˜์‘}} \times n}{C_{\text{์Šคํ†ก}}}$$

๋‹จ, ๊ฐ ์„ฑ๋ถ„์˜ ์Šคํ†ก๊ณผ ์ตœ์ข… ๋†๋„ ๋‹จ์œ„๋Š” ๋ฐ˜๋“œ์‹œ ์„œ๋กœ ์ผ์น˜ํ•ด์•ผ ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค(X๋Š” X๋ผ๋ฆฌ, mM์€ mM๋ผ๋ฆฌ, ยตM์€ ยตM๋ผ๋ฆฌ, U/ยตL์€ U/ยตL๋ผ๋ฆฌ).

์„ฑ๋ถ„ ๋ถ€ํ”ผ์™€ ๋ฌผ์˜ ํ•ฉ์ด ์ด ๋ฐ˜์‘ ๋ถ€ํ”ผ๊ฐ€ ๋จ์„ ๋ณด์—ฌ์ฃผ๋Š” ๋ˆ„์  ๋ง‰๋Œ€ ๋‹ค์ด์–ด๊ทธ๋žจ
๊ฐ ์„ฑ๋ถ„์˜ ๋ถ€ํ”ผ๋Š” ํฌ์„ ๊ณต์‹์œผ๋กœ ๊ตฌํ•˜๋ฉฐ, ๋‚˜๋จธ์ง€๋Š” ๋ฌผ๋กœ ์ตœ์ข… ๋ถ€ํ”ผ๊นŒ์ง€ ์ฑ„์›๋‹ˆ๋‹ค.

๊ณ„์‚ฐ ์˜ˆ์‹œ

25 ยตL ๋ฐ˜์‘ 10๊ฐœ๋ฅผ ์—ฌ์œ ๋ถ„ 10%๋กœ ์ค€๋น„ํ•œ๋‹ค๋ฉด \(n = 10 \times 1.10 = 11\)์ž…๋‹ˆ๋‹ค. 10X ๋ฒ„ํผ๋ฅผ 1X๋กœ ๋งŒ๋“ค๋ ค๋ฉด

$$\frac{1 \times 25 \times 11}{10} = 27.5\ \text{ยตL}$$

๊ฐ€ ํ•„์š”ํ•˜๊ณ , dNTP๋ฅผ 10 mM์—์„œ 0.2 mM๋กœ ๋งž์ถ”๋ ค๋ฉด

$$\frac{0.2 \times 25 \times 11}{10} = 5.5\ \text{ยตL}$$

๊ฐ€ ๋“ญ๋‹ˆ๋‹ค. ์ „์ฒด ๋ฏน์Šค ์šฉ๋Ÿ‰์€ \(25 \times 11 = 275\ \text{ยตL}\)์ด๋ฉฐ, ๋ฌผ์€ ๋ชจ๋“  ์‹œ์•ฝ๊ณผ ์ฃผํ˜•์„ ๋„ฃ๊ณ  ๋‚จ์€ ๋ถ€ํ”ผ๋ฅผ ์ฑ„์›๋‹ˆ๋‹ค.

์ž์ฃผ ๋ฌป๋Š” ์งˆ๋ฌธ

ํ”ผํŽซํŒ… ์—ฌ์œ ๋ถ„์€ ์™œ ๋„ฃ๋‚˜์š”? ํŒ ๋์ด๋‚˜ ํŠœ๋ธŒ ๋ฒฝ์— ๋ฌป์–ด ์‚ฌ๋ผ์ง€๋Š” ๋ฏธ์„ธํ•œ ์†์‹ค์ด ์Œ“์ด๊ธฐ ๋•Œ๋ฌธ์ž…๋‹ˆ๋‹ค. 5~10%๋ฅผ ๋” ์žก์•„๋‘๋ฉด ๋งˆ์ง€๋ง‰ ํŠœ๋ธŒ๊นŒ์ง€ ์˜จ์ „ํ•œ ๋ฐ˜์‘์•ก์ด ๋“ค์–ด๊ฐ‘๋‹ˆ๋‹ค.

๋ฌผ ์šฉ๋Ÿ‰์ด ์Œ์ˆ˜๋กœ ๋‚˜์˜ค๋ฉด ์–ด๋–ป๊ฒŒ ํ•˜๋‚˜์š”? ์‹œ์•ฝ ์šฉ๋Ÿ‰์˜ ํ•ฉ์ด ์ด๋ฏธ ๋ฐ˜์‘ ์šฉ๋Ÿ‰์„ ๋„˜์—ˆ๋‹ค๋Š” ๋œป์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ์ตœ์ข… ๋†๋„๋ฅผ ๋‚ฎ์ถ”๊ฑฐ๋‚˜, ์Šคํ†ก ๋†๋„๋ฅผ ๋†’์ด๊ฑฐ๋‚˜, ๋ฐ˜์‘ ์šฉ๋Ÿ‰์„ ๋Š˜๋ ค ๋ณด์„ธ์š”.

ํŠน์ • ์„ฑ๋ถ„์„ ๋น„์›Œ ๋‘˜ ์ˆ˜ ์žˆ๋‚˜์š”? ํ•ด๋‹น ์„ฑ๋ถ„์˜ ์Šคํ†ก์„ 0์œผ๋กœ ์„ค์ •ํ•˜๋ฉด ์ œ์™ธ๋ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ๊ทธ ์‹œ์•ฝ ์šฉ๋Ÿ‰์€ 0์ด ๋˜๊ณ  ๋ฌผ์ด ๊ทธ๋งŒํผ์„ ๋Œ€์‹  ์ฑ„์›๋‹ˆ๋‹ค.

์ตœ์ข… ์—…๋ฐ์ดํŠธ: