什麼是 PCR 反應預混液計算器?
PCR 反應預混液(master mix)計算器能算出配製一整批聚合酶連鎖反應(PCR)所需的各試劑用量。與其逐管加入每一種成分,不如先配好一份共用的預混液再分裝,既省時又能降低誤差。本工具會依反應管數再加上移液損耗預留量,將每種試劑按比例放大,確保配到最後一管都不會不夠用。
使用方法
先輸入單一反應體積、反應管數,以及移液損耗預留量(一般為 5~10%)。接著針對每種試劑,填入母液濃度與反應中所需的終濃度。計算器會回傳每種試劑的用量、模板 DNA 體積,以及用來補足總體積的無核酸酶水(nuclease-free water)體積。
公式說明
每種試劑的用量都源自稀釋關係式 \(C_1 V_1 = C_2 V_2\)。配製預混液時,再乘上有效反應數 \(n = \text{反應管數} \times \left(1 + \frac{\text{損耗%}}{100}\right)\):
$$V = \frac{C_{\text{終}} \times V_{\text{反應}} \times n}{C_{\text{母液}}}$$同一成分的母液濃度與終濃度單位必須一致(X 對 X、mM 對 mM、µM 對 µM、U/µL 對 U/µL)。
實例演算
以 10 個反應、每個 25 µL、預留 10% 損耗為例,\(n = 10 \times 1.10 = 11\)。要將 10X 緩衝液配成 1X,需要 $$\frac{1 \times 25 \times 11}{10} = 27.5\ \mu\text{L}$$;dNTPs 由 10 mM 稀釋到 0.2 mM,需要 $$\frac{0.2 \times 25 \times 11}{10} = 5.5\ \mu\text{L}$$。預混液總體積為 \(25 \times 11 = 275\ \mu\text{L}\),扣除所有試劑與模板後剩下的體積,就由水補足。
常見問題
為什麼要加移液損耗預留量?吸頭與管壁殘留的微量體積會逐次累積,多預留 5~10% 能確保最後一管也有完整的反應量。
如果算出來的水是負值怎麼辦?表示你的試劑總量已經超過反應體積——可降低某項終濃度、提高母液濃度,或加大反應體積。
可以略過某個成分嗎?把該成分的母液濃度設為 0 即可排除,該試劑用量會變成 0,並由水自動補足。